Jakość wody głównej jest bardzo ważna podczas pracy w zamkniętym systemie hydroponicznym. Woda deszczowa jest czysta i jest naturalnie najlepszym podstawowym źródłem wody do stosowania w uprawach hydroponicznych. Wodę deszczową zwykle pobiera się z dachu szklarni i przechowuje na terenie posesji. Wskazane jest wylanie wody, która została pobrana z pierwszych deszczowych dni po dłuższym okresie suszy, ponieważ może ona zawierać dużo brudu, a w obszarach przybrzeżnych również chlorek sodu. Jeśli wylanie wody nie jest możliwe, woda ta może zostać dodana do brudnego zbiornika wody drenażowej, aby przejść przez cykl oczyszczania i dezynfekcji przed użyciem jej jako wody do nawadniania. W przypadku braku wody deszczowej wymagane są inne źródła wody. Jednakże, jakość wody różni się w zależności od regionu i lokalizacji. Tabela 4 przedstawia przegląd minimalnych norm dla "dobrej jakości" wody głównej. Jeżeli woda nie spełnia kryteriów co najmniej klasy 3, nie nadaje się do stosowania w ogrodnictwie hydroponicznym w szklarni. W razie jakichkolwiek wątpliwości lub w celu uzyskania dalszych porad w zakresie jakości wody głównej, zalecamy skontaktowanie się z Groen Agro Control lub renomowanym laboratorium w swoim regionie.
